Protein–RNA interactions for Protein: Q01151

CD83, CD83 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD83Q01151 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD83Q01151 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD83Q01151 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD83Q01151 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD83Q01151 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD83Q01151 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD83Q01151 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD83Q01151 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD83Q01151 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD83Q01151 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
CD83Q01151 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD83Q01151 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CD83Q01151 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD83Q01151 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD83Q01151 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CD83Q01151 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD83Q01151 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD83Q01151 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD83Q01151 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD83Q01151 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CD83Q01151 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CD83Q01151 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CD83Q01151 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
CD83Q01151 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CD83Q01151 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CD83Q01151 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD83Q01151 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD83Q01151 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD83Q01151 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD83Q01151 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CD83Q01151 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD83Q01151 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD83Q01151 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD83Q01151 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD83Q01151 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD83Q01151 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD83Q01151 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD83Q01151 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD83Q01151 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD83Q01151 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD83Q01151 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD83Q01151 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD83Q01151 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CD83Q01151 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD83Q01151 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD83Q01151 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD83Q01151 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD83Q01151 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD83Q01151 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CD83Q01151 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CD83Q01151 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CD83Q01151 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD83Q01151 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CD83Q01151 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CD83Q01151 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD83Q01151 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD83Q01151 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD83Q01151 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD83Q01151 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CD83Q01151 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD83Q01151 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD83Q01151 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD83Q01151 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CD83Q01151 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CD83Q01151 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD83Q01151 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CD83Q01151 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD83Q01151 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD83Q01151 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD83Q01151 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD83Q01151 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD83Q01151 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD83Q01151 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD83Q01151 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CD83Q01151 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD83Q01151 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CD83Q01151 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD83Q01151 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD83Q01151 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD83Q01151 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD83Q01151 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD83Q01151 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CD83Q01151 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CD83Q01151 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
CD83Q01151 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD83Q01151 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD83Q01151 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD83Q01151 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD83Q01151 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD83Q01151 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD83Q01151 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD83Q01151 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD83Q01151 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD83Q01151 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD83Q01151 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD83Q01151 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD83Q01151 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD83Q01151 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD83Q01151 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CD83Q01151 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.5 ms