Protein–RNA interactions for Protein: P80192

MAP3K9, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,104 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K9P80192 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MAP3K9P80192 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MAP3K9P80192 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MAP3K9P80192 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
MAP3K9P80192 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
MAP3K9P80192 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
MAP3K9P80192 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.25■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
MAP3K9P80192 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
MAP3K9P80192 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
MAP3K9P80192 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
MAP3K9P80192 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MAP3K9P80192 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
MAP3K9P80192 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
MAP3K9P80192 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
MAP3K9P80192 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
MAP3K9P80192 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC28.13■■■□□ 2.09
MAP3K9P80192 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MAP3K9P80192 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MAP3K9P80192 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
MAP3K9P80192 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
MAP3K9P80192 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms