Protein–RNA interactions for Protein: P78357

CNTNAP1, Contactin-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,384 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTNAP1P78357 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
CNTNAP1P78357 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CNTNAP1P78357 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNTNAP1P78357 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNTNAP1P78357 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNTNAP1P78357 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNTNAP1P78357 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNTNAP1P78357 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNTNAP1P78357 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CNTNAP1P78357 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
CNTNAP1P78357 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
CNTNAP1P78357 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNTNAP1P78357 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNTNAP1P78357 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNTNAP1P78357 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNTNAP1P78357 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNTNAP1P78357 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
CNTNAP1P78357 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNTNAP1P78357 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
CNTNAP1P78357 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CNTNAP1P78357 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC28.72■■■□□ 2.19
CNTNAP1P78357 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNTNAP1P78357 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
CNTNAP1P78357 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNTNAP1P78357 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
CNTNAP1P78357 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNTNAP1P78357 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
CNTNAP1P78357 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
CNTNAP1P78357 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNTNAP1P78357 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNTNAP1P78357 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
CNTNAP1P78357 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
CNTNAP1P78357 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNTNAP1P78357 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNTNAP1P78357 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNTNAP1P78357 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNTNAP1P78357 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CNTNAP1P78357 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
CNTNAP1P78357 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNTNAP1P78357 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
CNTNAP1P78357 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNTNAP1P78357 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNTNAP1P78357 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNTNAP1P78357 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNTNAP1P78357 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNTNAP1P78357 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CNTNAP1P78357 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNTNAP1P78357 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
CNTNAP1P78357 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNTNAP1P78357 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CNTNAP1P78357 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CNTNAP1P78357 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CNTNAP1P78357 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CNTNAP1P78357 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CNTNAP1P78357 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CNTNAP1P78357 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 190.7 ms