Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBXN2AP68543 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
UBXN2AP68543 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBXN2AP68543 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBXN2AP68543 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBXN2AP68543 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBXN2AP68543 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
UBXN2AP68543 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBXN2AP68543 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBXN2AP68543 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
UBXN2AP68543 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBXN2AP68543 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBXN2AP68543 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBXN2AP68543 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
UBXN2AP68543 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
UBXN2AP68543 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
UBXN2AP68543 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBXN2AP68543 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBXN2AP68543 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC27.57■■■□□ 2
UBXN2AP68543 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBXN2AP68543 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBXN2AP68543 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
UBXN2AP68543 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBXN2AP68543 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
UBXN2AP68543 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
UBXN2AP68543 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBXN2AP68543 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
UBXN2AP68543 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
UBXN2AP68543 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
UBXN2AP68543 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBXN2AP68543 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
UBXN2AP68543 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC27.55■■■□□ 2
UBXN2AP68543 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBXN2AP68543 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBXN2AP68543 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
UBXN2AP68543 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC27.55■■■□□ 2
UBXN2AP68543 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
UBXN2AP68543 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
UBXN2AP68543 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
UBXN2AP68543 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
UBXN2AP68543 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC27.54■■■□□ 2
UBXN2AP68543 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBXN2AP68543 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBXN2AP68543 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
UBXN2AP68543 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
UBXN2AP68543 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC27.53■■■□□ 2
UBXN2AP68543 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
UBXN2AP68543 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
UBXN2AP68543 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
UBXN2AP68543 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC27.52■■■□□ 2
UBXN2AP68543 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
UBXN2AP68543 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
UBXN2AP68543 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
UBXN2AP68543 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
UBXN2AP68543 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms