Protein–RNA interactions for Protein: P61550

ERVS71-1, Endogenous retrovirus group S71 member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVS71-1P61550 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ERVS71-1P61550 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ERVS71-1P61550 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ERVS71-1P61550 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms