Protein–RNA interactions for Protein: P59089

LINC00205, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00205, humanhuman

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00205P59089 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.69
LINC00205P59089 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
LINC00205P59089 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
LINC00205P59089 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms