Protein–RNA interactions for Protein: P59025

RTP1, Receptor-transporting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTP1P59025 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RTP1P59025 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RTP1P59025 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
RTP1P59025 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
RTP1P59025 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTP1P59025 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTP1P59025 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTP1P59025 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTP1P59025 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
RTP1P59025 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTP1P59025 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
RTP1P59025 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTP1P59025 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTP1P59025 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTP1P59025 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTP1P59025 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTP1P59025 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTP1P59025 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
RTP1P59025 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTP1P59025 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTP1P59025 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
RTP1P59025 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTP1P59025 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTP1P59025 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
RTP1P59025 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTP1P59025 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTP1P59025 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTP1P59025 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTP1P59025 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTP1P59025 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTP1P59025 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
RTP1P59025 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
RTP1P59025 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RTP1P59025 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RTP1P59025 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RTP1P59025 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RTP1P59025 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
RTP1P59025 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
RTP1P59025 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RTP1P59025 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.89■■□□□ 1.9
RTP1P59025 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
RTP1P59025 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RTP1P59025 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
RTP1P59025 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
RTP1P59025 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RTP1P59025 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
RTP1P59025 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTP1P59025 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTP1P59025 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTP1P59025 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTP1P59025 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTP1P59025 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
RTP1P59025 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RTP1P59025 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTP1P59025 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RTP1P59025 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTP1P59025 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTP1P59025 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RTP1P59025 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTP1P59025 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTP1P59025 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTP1P59025 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RTP1P59025 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RTP1P59025 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RTP1P59025 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
RTP1P59025 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTP1P59025 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTP1P59025 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTP1P59025 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTP1P59025 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
RTP1P59025 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTP1P59025 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
RTP1P59025 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RTP1P59025 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RTP1P59025 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RTP1P59025 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RTP1P59025 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RTP1P59025 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
RTP1P59025 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RTP1P59025 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.88
RTP1P59025 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RTP1P59025 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
RTP1P59025 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTP1P59025 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTP1P59025 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTP1P59025 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTP1P59025 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTP1P59025 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTP1P59025 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RTP1P59025 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RTP1P59025 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RTP1P59025 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RTP1P59025 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RTP1P59025 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RTP1P59025 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RTP1P59025 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RTP1P59025 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RTP1P59025 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RTP1P59025 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RTP1P59025 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.2 ms