Protein–RNA interactions for Protein: P58499

FAM3B, Protein FAM3B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3BP58499 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
FAM3BP58499 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
FAM3BP58499 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
FAM3BP58499 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms