Protein–RNA interactions for Protein: P57053

H2BFS, Histone H2B type F-S, humanhuman

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2BFSP57053 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 EP400NL-214ENST00000641289 2402 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.7■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
H2BFSP57053 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
H2BFSP57053 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms