Protein–RNA interactions for Protein: P56524

HDAC4, Histone deacetylase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,084 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC4P56524 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC4P56524 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC4P56524 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC4P56524 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC4P56524 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
HDAC4P56524 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC4P56524 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC4P56524 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC4P56524 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC4P56524 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC4P56524 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
HDAC4P56524 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC4P56524 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC4P56524 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC4P56524 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC4P56524 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC4P56524 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC4P56524 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
HDAC4P56524 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
HDAC4P56524 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
HDAC4P56524 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.8 ms