Protein–RNA interactions for Protein: P51654

GPC3, Glypican-3, humanhuman

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC3P51654 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPC3P51654 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPC3P51654 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPC3P51654 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPC3P51654 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
GPC3P51654 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPC3P51654 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPC3P51654 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPC3P51654 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPC3P51654 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPC3P51654 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPC3P51654 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
GPC3P51654 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GPC3P51654 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.8
GPC3P51654 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.8
GPC3P51654 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
GPC3P51654 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPC3P51654 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPC3P51654 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPC3P51654 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPC3P51654 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPC3P51654 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPC3P51654 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPC3P51654 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
GPC3P51654 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
GPC3P51654 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPC3P51654 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
GPC3P51654 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
GPC3P51654 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPC3P51654 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPC3P51654 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
GPC3P51654 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
GPC3P51654 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPC3P51654 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPC3P51654 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPC3P51654 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
GPC3P51654 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPC3P51654 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPC3P51654 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPC3P51654 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPC3P51654 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
GPC3P51654 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GPC3P51654 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPC3P51654 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPC3P51654 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
GPC3P51654 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPC3P51654 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPC3P51654 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPC3P51654 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPC3P51654 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPC3P51654 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
GPC3P51654 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPC3P51654 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPC3P51654 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPC3P51654 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPC3P51654 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPC3P51654 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPC3P51654 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPC3P51654 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPC3P51654 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
GPC3P51654 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPC3P51654 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPC3P51654 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPC3P51654 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
GPC3P51654 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GPC3P51654 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
GPC3P51654 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPC3P51654 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPC3P51654 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPC3P51654 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPC3P51654 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
GPC3P51654 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPC3P51654 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPC3P51654 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPC3P51654 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPC3P51654 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPC3P51654 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
GPC3P51654 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPC3P51654 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPC3P51654 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPC3P51654 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
GPC3P51654 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPC3P51654 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GPC3P51654 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPC3P51654 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPC3P51654 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GPC3P51654 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
GPC3P51654 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPC3P51654 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPC3P51654 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
GPC3P51654 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GPC3P51654 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
GPC3P51654 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPC3P51654 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPC3P51654 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPC3P51654 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
GPC3P51654 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPC3P51654 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPC3P51654 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC26.19■■□□□ 1.78
GPC3P51654 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms