Protein–RNA interactions for Protein: P50461

CSRP3, Cysteine and glycine-rich protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 194 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP3P50461 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
CSRP3P50461 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CSRP3P50461 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSRP3P50461 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSRP3P50461 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.3 ms