Protein–RNA interactions for Protein: P49815

TSC2, Tuberin, humanhuman

Predictions only

Length 1,807 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC2P49815 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
TSC2P49815 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
TSC2P49815 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSC2P49815 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSC2P49815 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
TSC2P49815 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
TSC2P49815 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSC2P49815 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSC2P49815 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSC2P49815 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
TSC2P49815 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSC2P49815 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSC2P49815 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
TSC2P49815 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSC2P49815 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSC2P49815 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSC2P49815 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSC2P49815 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSC2P49815 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSC2P49815 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSC2P49815 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSC2P49815 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TSC2P49815 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TSC2P49815 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSC2P49815 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSC2P49815 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSC2P49815 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TSC2P49815 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSC2P49815 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSC2P49815 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSC2P49815 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSC2P49815 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TSC2P49815 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TSC2P49815 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TSC2P49815 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
TSC2P49815 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TSC2P49815 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSC2P49815 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSC2P49815 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSC2P49815 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSC2P49815 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSC2P49815 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TSC2P49815 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSC2P49815 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSC2P49815 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSC2P49815 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSC2P49815 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSC2P49815 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TSC2P49815 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSC2P49815 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSC2P49815 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSC2P49815 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSC2P49815 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSC2P49815 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSC2P49815 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TSC2P49815 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TSC2P49815 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSC2P49815 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSC2P49815 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSC2P49815 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TSC2P49815 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSC2P49815 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSC2P49815 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSC2P49815 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TSC2P49815 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSC2P49815 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSC2P49815 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSC2P49815 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSC2P49815 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSC2P49815 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TSC2P49815 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSC2P49815 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSC2P49815 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSC2P49815 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TSC2P49815 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSC2P49815 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSC2P49815 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSC2P49815 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSC2P49815 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSC2P49815 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
TSC2P49815 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TSC2P49815 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSC2P49815 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSC2P49815 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSC2P49815 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSC2P49815 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
TSC2P49815 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSC2P49815 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TSC2P49815 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSC2P49815 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSC2P49815 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSC2P49815 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TSC2P49815 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSC2P49815 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TSC2P49815 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TSC2P49815 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TSC2P49815 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSC2P49815 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TSC2P49815 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TSC2P49815 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms