Protein–RNA interactions for Protein: P48764

SLC9A3, Sodium/hydrogen exchanger 3, humanhuman

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A3P48764 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
SLC9A3P48764 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
SLC9A3P48764 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
SLC9A3P48764 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms