Protein–RNA interactions for Protein: P46060

RANGAP1, Ran GTPase-activating protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RANGAP1P46060 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC38.44■■■■□ 3.74
RANGAP1P46060 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC38.44■■■■□ 3.74
RANGAP1P46060 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC38.43■■■■□ 3.74
RANGAP1P46060 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
RANGAP1P46060 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC38.43■■■■□ 3.74
RANGAP1P46060 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC38.43■■■■□ 3.74
RANGAP1P46060 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
RANGAP1P46060 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
RANGAP1P46060 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.42■■■■□ 3.74
RANGAP1P46060 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC38.42■■■■□ 3.74
RANGAP1P46060 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
RANGAP1P46060 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC38.41■■■■□ 3.74
RANGAP1P46060 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.41■■■■□ 3.74
RANGAP1P46060 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.4■■■■□ 3.74
RANGAP1P46060 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.4■■■■□ 3.74
RANGAP1P46060 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
RANGAP1P46060 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.4■■■■□ 3.74
RANGAP1P46060 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
RANGAP1P46060 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
RANGAP1P46060 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.39■■■■□ 3.74
RANGAP1P46060 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC38.39■■■■□ 3.74
RANGAP1P46060 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
RANGAP1P46060 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
RANGAP1P46060 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
RANGAP1P46060 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC38.38■■■■□ 3.73
RANGAP1P46060 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC38.38■■■■□ 3.73
RANGAP1P46060 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.38■■■■□ 3.73
RANGAP1P46060 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC38.37■■■■□ 3.73
RANGAP1P46060 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC38.37■■■■□ 3.73
RANGAP1P46060 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC38.37■■■■□ 3.73
RANGAP1P46060 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
RANGAP1P46060 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.37■■■■□ 3.73
RANGAP1P46060 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.37■■■■□ 3.73
RANGAP1P46060 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
RANGAP1P46060 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
RANGAP1P46060 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC38.36■■■■□ 3.73
RANGAP1P46060 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
RANGAP1P46060 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
RANGAP1P46060 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.35■■■■□ 3.73
RANGAP1P46060 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
RANGAP1P46060 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
RANGAP1P46060 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
RANGAP1P46060 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
RANGAP1P46060 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC38.34■■■■□ 3.73
RANGAP1P46060 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
RANGAP1P46060 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
RANGAP1P46060 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
RANGAP1P46060 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
RANGAP1P46060 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC38.33■■■■□ 3.73
RANGAP1P46060 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
RANGAP1P46060 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC38.33■■■■□ 3.73
RANGAP1P46060 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
RANGAP1P46060 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
RANGAP1P46060 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC38.33■■■■□ 3.73
RANGAP1P46060 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC38.32■■■■□ 3.73
RANGAP1P46060 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC38.32■■■■□ 3.72
RANGAP1P46060 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.72
RANGAP1P46060 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.72
RANGAP1P46060 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
RANGAP1P46060 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.31■■■■□ 3.72
RANGAP1P46060 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
RANGAP1P46060 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
RANGAP1P46060 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
RANGAP1P46060 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
RANGAP1P46060 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
RANGAP1P46060 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC38.3■■■■□ 3.72
RANGAP1P46060 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
RANGAP1P46060 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC38.3■■■■□ 3.72
RANGAP1P46060 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC38.3■■■■□ 3.72
RANGAP1P46060 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
RANGAP1P46060 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
RANGAP1P46060 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
RANGAP1P46060 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
RANGAP1P46060 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.27■■■■□ 3.72
RANGAP1P46060 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
RANGAP1P46060 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
RANGAP1P46060 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC38.26■■■■□ 3.72
RANGAP1P46060 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
RANGAP1P46060 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.72
RANGAP1P46060 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC38.26■■■■□ 3.71
RANGAP1P46060 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
RANGAP1P46060 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC38.25■■■■□ 3.71
RANGAP1P46060 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
RANGAP1P46060 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
RANGAP1P46060 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
RANGAP1P46060 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
RANGAP1P46060 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
RANGAP1P46060 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
RANGAP1P46060 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
RANGAP1P46060 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
RANGAP1P46060 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.22■■■■□ 3.71
RANGAP1P46060 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
RANGAP1P46060 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
RANGAP1P46060 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
RANGAP1P46060 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
RANGAP1P46060 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC38.2■■■■□ 3.71
RANGAP1P46060 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
RANGAP1P46060 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
RANGAP1P46060 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.19■■■■□ 3.7
RANGAP1P46060 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.1 ms