Protein–RNA interactions for Protein: P43897

TSFM, Elongation factor Ts, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSFMP43897 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSFMP43897 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSFMP43897 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TSFMP43897 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSFMP43897 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSFMP43897 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TSFMP43897 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSFMP43897 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSFMP43897 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TSFMP43897 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TSFMP43897 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
TSFMP43897 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSFMP43897 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TSFMP43897 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TSFMP43897 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
TSFMP43897 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TSFMP43897 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSFMP43897 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSFMP43897 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSFMP43897 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSFMP43897 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSFMP43897 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSFMP43897 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSFMP43897 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TSFMP43897 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSFMP43897 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TSFMP43897 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TSFMP43897 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSFMP43897 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TSFMP43897 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSFMP43897 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSFMP43897 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSFMP43897 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSFMP43897 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSFMP43897 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSFMP43897 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSFMP43897 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSFMP43897 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSFMP43897 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSFMP43897 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSFMP43897 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TSFMP43897 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSFMP43897 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSFMP43897 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSFMP43897 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSFMP43897 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSFMP43897 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TSFMP43897 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSFMP43897 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TSFMP43897 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSFMP43897 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSFMP43897 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
TSFMP43897 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSFMP43897 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSFMP43897 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSFMP43897 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSFMP43897 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSFMP43897 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSFMP43897 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TSFMP43897 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSFMP43897 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSFMP43897 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSFMP43897 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSFMP43897 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TSFMP43897 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSFMP43897 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSFMP43897 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TSFMP43897 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSFMP43897 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSFMP43897 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSFMP43897 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSFMP43897 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSFMP43897 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSFMP43897 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSFMP43897 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSFMP43897 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSFMP43897 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TSFMP43897 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSFMP43897 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSFMP43897 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSFMP43897 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSFMP43897 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSFMP43897 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSFMP43897 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSFMP43897 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSFMP43897 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSFMP43897 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSFMP43897 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TSFMP43897 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSFMP43897 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSFMP43897 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TSFMP43897 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TSFMP43897 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TSFMP43897 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSFMP43897 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSFMP43897 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSFMP43897 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSFMP43897 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSFMP43897 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
TSFMP43897 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 330.3 ms