Protein–RNA interactions for Protein: P36955

SERPINF1, Pigment epithelium-derived factor, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINF1P36955 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
SERPINF1P36955 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
SERPINF1P36955 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
SERPINF1P36955 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.3 ms