Protein–RNA interactions for Protein: P33897

ABCD1, ATP-binding cassette sub-family D member 1, humanhuman

Predictions only

Length 745 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCD1P33897 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
ABCD1P33897 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ABCD1P33897 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCD1P33897 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCD1P33897 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCD1P33897 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCD1P33897 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCD1P33897 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCD1P33897 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCD1P33897 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCD1P33897 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ABCD1P33897 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCD1P33897 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCD1P33897 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCD1P33897 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCD1P33897 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ABCD1P33897 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCD1P33897 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCD1P33897 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
ABCD1P33897 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCD1P33897 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCD1P33897 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCD1P33897 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCD1P33897 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCD1P33897 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCD1P33897 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCD1P33897 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ABCD1P33897 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCD1P33897 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ABCD1P33897 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
ABCD1P33897 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
ABCD1P33897 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC26■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ABCD1P33897 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCD1P33897 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCD1P33897 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCD1P33897 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCD1P33897 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCD1P33897 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ABCD1P33897 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCD1P33897 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCD1P33897 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCD1P33897 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCD1P33897 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ABCD1P33897 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCD1P33897 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCD1P33897 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCD1P33897 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCD1P33897 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ABCD1P33897 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCD1P33897 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCD1P33897 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCD1P33897 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCD1P33897 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ABCD1P33897 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ABCD1P33897 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.9 ms