Protein–RNA interactions for Protein: P33527

ABCC1, Multidrug resistance-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC1P33527 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
ABCC1P33527 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
ABCC1P33527 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC36.37■■■■□ 3.41
ABCC1P33527 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ABCC1P33527 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
ABCC1P33527 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
ABCC1P33527 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ABCC1P33527 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
ABCC1P33527 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ABCC1P33527 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
ABCC1P33527 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCC1P33527 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCC1P33527 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCC1P33527 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
ABCC1P33527 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ABCC1P33527 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC36.33■■■■□ 3.41
ABCC1P33527 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
ABCC1P33527 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.41
ABCC1P33527 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
ABCC1P33527 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
ABCC1P33527 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
ABCC1P33527 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.41
ABCC1P33527 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
ABCC1P33527 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
ABCC1P33527 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
ABCC1P33527 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
ABCC1P33527 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
ABCC1P33527 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
ABCC1P33527 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ABCC1P33527 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
ABCC1P33527 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ABCC1P33527 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC36.3■■■■□ 3.4
ABCC1P33527 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
ABCC1P33527 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
ABCC1P33527 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC36.3■■■■□ 3.4
ABCC1P33527 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
ABCC1P33527 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ABCC1P33527 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ABCC1P33527 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ABCC1P33527 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
ABCC1P33527 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
ABCC1P33527 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ABCC1P33527 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
ABCC1P33527 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
ABCC1P33527 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
ABCC1P33527 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ABCC1P33527 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ABCC1P33527 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
ABCC1P33527 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
ABCC1P33527 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
ABCC1P33527 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ABCC1P33527 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ABCC1P33527 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
ABCC1P33527 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ABCC1P33527 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ABCC1P33527 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
ABCC1P33527 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ABCC1P33527 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC36.23■■■■□ 3.39
ABCC1P33527 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
ABCC1P33527 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ABCC1P33527 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC36.22■■■■□ 3.39
ABCC1P33527 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ABCC1P33527 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ABCC1P33527 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
ABCC1P33527 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ABCC1P33527 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ABCC1P33527 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ABCC1P33527 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
ABCC1P33527 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ABCC1P33527 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
ABCC1P33527 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
ABCC1P33527 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ABCC1P33527 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
ABCC1P33527 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ABCC1P33527 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ABCC1P33527 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
ABCC1P33527 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ABCC1P33527 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC36.19■■■■□ 3.38
ABCC1P33527 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
ABCC1P33527 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
ABCC1P33527 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
ABCC1P33527 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC1P33527 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC1P33527 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC1P33527 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC1P33527 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC1P33527 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC1P33527 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
ABCC1P33527 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ABCC1P33527 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ABCC1P33527 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ABCC1P33527 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ABCC1P33527 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC36.17■■■■□ 3.38
ABCC1P33527 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ABCC1P33527 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
ABCC1P33527 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ABCC1P33527 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.17■■■■□ 3.38
ABCC1P33527 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
ABCC1P33527 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.15■■■■□ 3.38
ABCC1P33527 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms