Protein–RNA interactions for Protein: P29508

SERPINB3, Serpin B3, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERPINB3P29508 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
SERPINB3P29508 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SERPINB3P29508 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SERPINB3P29508 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 238.2 ms