Protein–RNA interactions for Protein: P29279

CTGF, Connective tissue growth factor, humanhuman

Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTGFP29279 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTGFP29279 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTGFP29279 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTGFP29279 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
CTGFP29279 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
CTGFP29279 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTGFP29279 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTGFP29279 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTGFP29279 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTGFP29279 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTGFP29279 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTGFP29279 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTGFP29279 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTGFP29279 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
CTGFP29279 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTGFP29279 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTGFP29279 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
CTGFP29279 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTGFP29279 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTGFP29279 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
CTGFP29279 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTGFP29279 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
CTGFP29279 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTGFP29279 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTGFP29279 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTGFP29279 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
CTGFP29279 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTGFP29279 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTGFP29279 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTGFP29279 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
CTGFP29279 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTGFP29279 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTGFP29279 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTGFP29279 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTGFP29279 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTGFP29279 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTGFP29279 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.3■■□□□ 1.96
CTGFP29279 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTGFP29279 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTGFP29279 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTGFP29279 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTGFP29279 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTGFP29279 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTGFP29279 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTGFP29279 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTGFP29279 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTGFP29279 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
CTGFP29279 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTGFP29279 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTGFP29279 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTGFP29279 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CTGFP29279 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CTGFP29279 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTGFP29279 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
CTGFP29279 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
CTGFP29279 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTGFP29279 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTGFP29279 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
CTGFP29279 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CTGFP29279 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
CTGFP29279 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.26■■□□□ 1.96
CTGFP29279 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.95
CTGFP29279 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTGFP29279 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTGFP29279 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
CTGFP29279 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTGFP29279 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTGFP29279 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
CTGFP29279 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTGFP29279 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTGFP29279 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTGFP29279 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTGFP29279 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTGFP29279 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTGFP29279 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
CTGFP29279 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTGFP29279 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTGFP29279 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTGFP29279 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTGFP29279 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
CTGFP29279 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTGFP29279 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CTGFP29279 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTGFP29279 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CTGFP29279 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
CTGFP29279 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTGFP29279 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTGFP29279 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTGFP29279 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
CTGFP29279 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTGFP29279 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CTGFP29279 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTGFP29279 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTGFP29279 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTGFP29279 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTGFP29279 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTGFP29279 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTGFP29279 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTGFP29279 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CTGFP29279 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.1 ms