Protein–RNA interactions for Protein: P29017

CD1C, T-cell surface glycoprotein CD1c, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD1CP29017 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD1CP29017 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD1CP29017 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD1CP29017 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CD1CP29017 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD1CP29017 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD1CP29017 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD1CP29017 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CD1CP29017 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD1CP29017 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD1CP29017 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD1CP29017 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD1CP29017 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD1CP29017 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD1CP29017 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD1CP29017 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CD1CP29017 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD1CP29017 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD1CP29017 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD1CP29017 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD1CP29017 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD1CP29017 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD1CP29017 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD1CP29017 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD1CP29017 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD1CP29017 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CD1CP29017 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD1CP29017 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD1CP29017 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD1CP29017 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CD1CP29017 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD1CP29017 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD1CP29017 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD1CP29017 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD1CP29017 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD1CP29017 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CD1CP29017 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CD1CP29017 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD1CP29017 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD1CP29017 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD1CP29017 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CD1CP29017 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD1CP29017 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD1CP29017 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CD1CP29017 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CD1CP29017 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD1CP29017 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD1CP29017 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD1CP29017 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD1CP29017 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CD1CP29017 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD1CP29017 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD1CP29017 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD1CP29017 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CD1CP29017 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD1CP29017 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CD1CP29017 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD1CP29017 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD1CP29017 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD1CP29017 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
CD1CP29017 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD1CP29017 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD1CP29017 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CD1CP29017 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD1CP29017 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD1CP29017 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD1CP29017 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD1CP29017 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD1CP29017 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD1CP29017 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CD1CP29017 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD1CP29017 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD1CP29017 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD1CP29017 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD1CP29017 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD1CP29017 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CD1CP29017 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD1CP29017 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD1CP29017 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD1CP29017 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD1CP29017 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CD1CP29017 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD1CP29017 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD1CP29017 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD1CP29017 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD1CP29017 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD1CP29017 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD1CP29017 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD1CP29017 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD1CP29017 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD1CP29017 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CD1CP29017 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD1CP29017 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD1CP29017 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD1CP29017 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD1CP29017 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD1CP29017 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD1CP29017 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD1CP29017 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
CD1CP29017 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms