Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
HOXD10P28358 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXD10P28358 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXD10P28358 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
HOXD10P28358 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXD10P28358 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXD10P28358 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
HOXD10P28358 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXD10P28358 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXD10P28358 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXD10P28358 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
HOXD10P28358 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
HOXD10P28358 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
HOXD10P28358 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXD10P28358 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXD10P28358 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXD10P28358 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
HOXD10P28358 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXD10P28358 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXD10P28358 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXD10P28358 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
HOXD10P28358 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXD10P28358 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXD10P28358 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXD10P28358 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXD10P28358 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXD10P28358 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
HOXD10P28358 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXD10P28358 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXD10P28358 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXD10P28358 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
HOXD10P28358 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXD10P28358 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXD10P28358 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXD10P28358 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXD10P28358 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXD10P28358 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
HOXD10P28358 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXD10P28358 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXD10P28358 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXD10P28358 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXD10P28358 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
HOXD10P28358 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
HOXD10P28358 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.7 ms