Protein–RNA interactions for Protein: P22670

RFX1, MHC class II regulatory factor RFX1, humanhuman

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX1P22670 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFX1P22670 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RFX1P22670 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RFX1P22670 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RFX1P22670 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFX1P22670 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFX1P22670 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RFX1P22670 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
RFX1P22670 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
RFX1P22670 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFX1P22670 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RFX1P22670 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
RFX1P22670 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFX1P22670 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RFX1P22670 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RFX1P22670 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RFX1P22670 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RFX1P22670 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RFX1P22670 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFX1P22670 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFX1P22670 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFX1P22670 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFX1P22670 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RFX1P22670 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFX1P22670 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFX1P22670 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFX1P22670 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFX1P22670 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFX1P22670 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFX1P22670 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
RFX1P22670 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFX1P22670 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RFX1P22670 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFX1P22670 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
RFX1P22670 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFX1P22670 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFX1P22670 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFX1P22670 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
RFX1P22670 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFX1P22670 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFX1P22670 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFX1P22670 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFX1P22670 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
RFX1P22670 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RFX1P22670 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RFX1P22670 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RFX1P22670 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RFX1P22670 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RFX1P22670 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RFX1P22670 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
RFX1P22670 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RFX1P22670 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
RFX1P22670 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
RFX1P22670 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFX1P22670 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
RFX1P22670 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFX1P22670 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFX1P22670 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFX1P22670 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFX1P22670 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFX1P22670 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFX1P22670 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
RFX1P22670 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RFX1P22670 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RFX1P22670 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RFX1P22670 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RFX1P22670 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RFX1P22670 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RFX1P22670 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RFX1P22670 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RFX1P22670 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RFX1P22670 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RFX1P22670 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
RFX1P22670 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
RFX1P22670 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RFX1P22670 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RFX1P22670 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RFX1P22670 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
RFX1P22670 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RFX1P22670 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
RFX1P22670 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RFX1P22670 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RFX1P22670 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
RFX1P22670 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RFX1P22670 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RFX1P22670 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RFX1P22670 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
RFX1P22670 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
RFX1P22670 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFX1P22670 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFX1P22670 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFX1P22670 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFX1P22670 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
RFX1P22670 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RFX1P22670 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RFX1P22670 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RFX1P22670 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
RFX1P22670 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
RFX1P22670 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
RFX1P22670 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.1 ms