Protein–RNA interactions for Protein: P19429

TNNI3, Troponin I, cardiac muscle, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI3P19429 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
TNNI3P19429 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TNNI3P19429 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
TNNI3P19429 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.9 ms