Protein–RNA interactions for Protein: P18858

LIG1, DNA ligase 1, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIG1P18858 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
LIG1P18858 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LIG1P18858 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
LIG1P18858 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
LIG1P18858 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LIG1P18858 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LIG1P18858 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
LIG1P18858 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
LIG1P18858 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LIG1P18858 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
LIG1P18858 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
LIG1P18858 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LIG1P18858 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LIG1P18858 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LIG1P18858 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LIG1P18858 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
LIG1P18858 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LIG1P18858 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
LIG1P18858 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LIG1P18858 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LIG1P18858 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
LIG1P18858 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LIG1P18858 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LIG1P18858 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LIG1P18858 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
LIG1P18858 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
LIG1P18858 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LIG1P18858 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
LIG1P18858 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LIG1P18858 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LIG1P18858 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
LIG1P18858 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LIG1P18858 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LIG1P18858 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LIG1P18858 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
LIG1P18858 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
LIG1P18858 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LIG1P18858 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LIG1P18858 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LIG1P18858 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LIG1P18858 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC27.19■■□□□ 1.94
LIG1P18858 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LIG1P18858 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LIG1P18858 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LIG1P18858 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LIG1P18858 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LIG1P18858 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LIG1P18858 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LIG1P18858 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
LIG1P18858 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LIG1P18858 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
LIG1P18858 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LIG1P18858 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LIG1P18858 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LIG1P18858 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
LIG1P18858 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
LIG1P18858 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LIG1P18858 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
LIG1P18858 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LIG1P18858 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LIG1P18858 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
LIG1P18858 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LIG1P18858 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
LIG1P18858 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LIG1P18858 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LIG1P18858 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LIG1P18858 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LIG1P18858 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LIG1P18858 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LIG1P18858 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
LIG1P18858 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
LIG1P18858 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LIG1P18858 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
LIG1P18858 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
LIG1P18858 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LIG1P18858 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
LIG1P18858 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LIG1P18858 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
LIG1P18858 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LIG1P18858 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LIG1P18858 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LIG1P18858 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
LIG1P18858 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
LIG1P18858 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
LIG1P18858 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LIG1P18858 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
LIG1P18858 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LIG1P18858 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LIG1P18858 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LIG1P18858 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC27.13■■□□□ 1.93
LIG1P18858 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LIG1P18858 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LIG1P18858 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LIG1P18858 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LIG1P18858 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
LIG1P18858 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
LIG1P18858 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
LIG1P18858 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.11■■□□□ 1.93
LIG1P18858 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
LIG1P18858 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.4 ms