Protein–RNA interactions for Protein: P18621

RPL17, 60S ribosomal protein L17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17P18621 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL17P18621 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL17P18621 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL17P18621 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL17P18621 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL17P18621 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
RPL17P18621 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL17P18621 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL17P18621 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
RPL17P18621 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPL17P18621 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPL17P18621 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPL17P18621 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPL17P18621 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPL17P18621 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
RPL17P18621 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPL17P18621 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPL17P18621 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
RPL17P18621 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPL17P18621 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPL17P18621 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPL17P18621 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPL17P18621 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPL17P18621 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
RPL17P18621 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL17P18621 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL17P18621 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL17P18621 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL17P18621 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL17P18621 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL17P18621 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
RPL17P18621 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPL17P18621 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPL17P18621 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
RPL17P18621 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
RPL17P18621 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPL17P18621 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPL17P18621 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
RPL17P18621 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
RPL17P18621 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPL17P18621 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPL17P18621 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPL17P18621 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
RPL17P18621 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPL17P18621 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPL17P18621 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RPL17P18621 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RPL17P18621 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL17P18621 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL17P18621 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL17P18621 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL17P18621 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL17P18621 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL17P18621 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL17P18621 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RPL17P18621 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPL17P18621 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPL17P18621 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPL17P18621 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RPL17P18621 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL17P18621 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL17P18621 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL17P18621 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL17P18621 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL17P18621 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL17P18621 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL17P18621 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL17P18621 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL17P18621 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL17P18621 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RPL17P18621 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL17P18621 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL17P18621 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL17P18621 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL17P18621 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL17P18621 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL17P18621 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL17P18621 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL17P18621 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL17P18621 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RPL17P18621 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL17P18621 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL17P18621 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL17P18621 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL17P18621 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RPL17P18621 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPL17P18621 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPL17P18621 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPL17P18621 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RPL17P18621 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL17P18621 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL17P18621 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL17P18621 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL17P18621 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL17P18621 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RPL17P18621 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPL17P18621 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPL17P18621 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPL17P18621 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
RPL17P18621 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms