Protein–RNA interactions for Protein: P17035

ZNF28, Zinc finger protein 28, humanhuman

Predictions only

Length 718 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF28P17035 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
ZNF28P17035 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ZNF28P17035 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ZNF28P17035 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms