Protein–RNA interactions for Protein: P16949

STMN1, Stathmin, humanhuman

Predictions only

Length 149 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STMN1P16949 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STMN1P16949 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STMN1P16949 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STMN1P16949 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STMN1P16949 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STMN1P16949 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
STMN1P16949 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
STMN1P16949 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STMN1P16949 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STMN1P16949 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STMN1P16949 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STMN1P16949 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STMN1P16949 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
STMN1P16949 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
STMN1P16949 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
STMN1P16949 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STMN1P16949 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STMN1P16949 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
STMN1P16949 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STMN1P16949 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
STMN1P16949 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STMN1P16949 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STMN1P16949 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
STMN1P16949 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
STMN1P16949 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STMN1P16949 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
STMN1P16949 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STMN1P16949 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STMN1P16949 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STMN1P16949 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
STMN1P16949 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STMN1P16949 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STMN1P16949 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
STMN1P16949 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
STMN1P16949 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STMN1P16949 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STMN1P16949 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STMN1P16949 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STMN1P16949 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STMN1P16949 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STMN1P16949 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STMN1P16949 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
STMN1P16949 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
STMN1P16949 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STMN1P16949 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STMN1P16949 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STMN1P16949 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
STMN1P16949 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STMN1P16949 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STMN1P16949 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STMN1P16949 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
STMN1P16949 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STMN1P16949 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STMN1P16949 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STMN1P16949 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STMN1P16949 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STMN1P16949 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STMN1P16949 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STMN1P16949 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
STMN1P16949 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
STMN1P16949 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STMN1P16949 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STMN1P16949 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STMN1P16949 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
STMN1P16949 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
STMN1P16949 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STMN1P16949 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
STMN1P16949 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STMN1P16949 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STMN1P16949 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STMN1P16949 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STMN1P16949 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
STMN1P16949 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
STMN1P16949 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STMN1P16949 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STMN1P16949 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STMN1P16949 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STMN1P16949 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
STMN1P16949 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STMN1P16949 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STMN1P16949 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STMN1P16949 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
STMN1P16949 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
STMN1P16949 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STMN1P16949 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STMN1P16949 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STMN1P16949 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
STMN1P16949 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
STMN1P16949 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STMN1P16949 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STMN1P16949 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STMN1P16949 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
STMN1P16949 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STMN1P16949 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
STMN1P16949 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STMN1P16949 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STMN1P16949 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STMN1P16949 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
STMN1P16949 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
STMN1P16949 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.2 ms