Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
IFITM1P13164 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
IFITM1P13164 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
IFITM1P13164 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.2 ms