Protein–RNA interactions for Protein: P11532

DMD, Dystrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DMDP11532 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DMDP11532 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DMDP11532 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DMDP11532 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DMDP11532 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DMDP11532 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DMDP11532 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DMDP11532 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DMDP11532 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DMDP11532 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DMDP11532 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DMDP11532 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DMDP11532 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DMDP11532 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DMDP11532 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DMDP11532 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DMDP11532 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DMDP11532 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DMDP11532 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DMDP11532 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DMDP11532 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DMDP11532 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DMDP11532 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DMDP11532 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DMDP11532 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
DMDP11532 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
DMDP11532 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DMDP11532 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
DMDP11532 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
DMDP11532 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DMDP11532 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
DMDP11532 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
DMDP11532 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
DMDP11532 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DMDP11532 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
DMDP11532 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
DMDP11532 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DMDP11532 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
DMDP11532 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
DMDP11532 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DMDP11532 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DMDP11532 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DMDP11532 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
DMDP11532 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DMDP11532 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DMDP11532 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
DMDP11532 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DMDP11532 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DMDP11532 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DMDP11532 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DMDP11532 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DMDP11532 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
DMDP11532 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
DMDP11532 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
DMDP11532 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DMDP11532 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DMDP11532 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DMDP11532 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DMDP11532 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
DMDP11532 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DMDP11532 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DMDP11532 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
DMDP11532 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
DMDP11532 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
DMDP11532 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
DMDP11532 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
DMDP11532 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
DMDP11532 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DMDP11532 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DMDP11532 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
DMDP11532 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DMDP11532 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
DMDP11532 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DMDP11532 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DMDP11532 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DMDP11532 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DMDP11532 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DMDP11532 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DMDP11532 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
DMDP11532 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
DMDP11532 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DMDP11532 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
DMDP11532 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
DMDP11532 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
DMDP11532 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DMDP11532 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DMDP11532 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DMDP11532 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
DMDP11532 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DMDP11532 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DMDP11532 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
DMDP11532 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DMDP11532 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
DMDP11532 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DMDP11532 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
DMDP11532 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC23.78■■□□□ 1.4
DMDP11532 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
DMDP11532 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
DMDP11532 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
DMDP11532 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.4 ms