Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
CHGAP10645 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CHGAP10645 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CHGAP10645 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
CHGAP10645 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CHGAP10645 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
CHGAP10645 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CHGAP10645 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
CHGAP10645 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
CHGAP10645 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
CHGAP10645 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CHGAP10645 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CHGAP10645 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
CHGAP10645 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
CHGAP10645 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CHGAP10645 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CHGAP10645 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
CHGAP10645 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC34.54■■■■□ 3.12
CHGAP10645 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC34.54■■■■□ 3.12
CHGAP10645 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CHGAP10645 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CHGAP10645 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CHGAP10645 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CHGAP10645 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CHGAP10645 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CHGAP10645 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CHGAP10645 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.53■■■■□ 3.12
CHGAP10645 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
CHGAP10645 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
CHGAP10645 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CHGAP10645 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CHGAP10645 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CHGAP10645 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
CHGAP10645 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC34.51■■■■□ 3.12
CHGAP10645 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CHGAP10645 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.12
CHGAP10645 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CHGAP10645 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CHGAP10645 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CHGAP10645 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CHGAP10645 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CHGAP10645 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CHGAP10645 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CHGAP10645 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
CHGAP10645 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
CHGAP10645 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
CHGAP10645 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CHGAP10645 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CHGAP10645 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
CHGAP10645 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CHGAP10645 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CHGAP10645 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CHGAP10645 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
CHGAP10645 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
CHGAP10645 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
CHGAP10645 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CHGAP10645 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CHGAP10645 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
CHGAP10645 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
CHGAP10645 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
CHGAP10645 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
CHGAP10645 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
CHGAP10645 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CHGAP10645 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CHGAP10645 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
CHGAP10645 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CHGAP10645 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC34.45■■■■□ 3.11
CHGAP10645 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC34.45■■■■□ 3.11
CHGAP10645 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CHGAP10645 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CHGAP10645 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CHGAP10645 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
CHGAP10645 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CHGAP10645 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CHGAP10645 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CHGAP10645 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
CHGAP10645 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CHGAP10645 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CHGAP10645 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
CHGAP10645 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
CHGAP10645 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CHGAP10645 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CHGAP10645 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CHGAP10645 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CHGAP10645 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
CHGAP10645 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
CHGAP10645 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CHGAP10645 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CHGAP10645 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
CHGAP10645 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC34.41■■■■□ 3.1
CHGAP10645 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
CHGAP10645 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CHGAP10645 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CHGAP10645 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC34.4■■■■□ 3.1
CHGAP10645 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
CHGAP10645 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
CHGAP10645 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CHGAP10645 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CHGAP10645 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
CHGAP10645 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms