Protein–RNA interactions for Protein: P10075

GLI4, Zinc finger protein GLI4, humanhuman

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GLI4P10075 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GLI4P10075 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLI4P10075 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GLI4P10075 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GLI4P10075 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
GLI4P10075 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
GLI4P10075 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GLI4P10075 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
GLI4P10075 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLI4P10075 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLI4P10075 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
GLI4P10075 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLI4P10075 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
GLI4P10075 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
GLI4P10075 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.27■■□□□ 1
GLI4P10075 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
GLI4P10075 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI4P10075 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI4P10075 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI4P10075 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI4P10075 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI4P10075 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI4P10075 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI4P10075 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI4P10075 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
GLI4P10075 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLI4P10075 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLI4P10075 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLI4P10075 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLI4P10075 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLI4P10075 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLI4P10075 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLI4P10075 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLI4P10075 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
GLI4P10075 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLI4P10075 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLI4P10075 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLI4P10075 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLI4P10075 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLI4P10075 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLI4P10075 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLI4P10075 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLI4P10075 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLI4P10075 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLI4P10075 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GLI4P10075 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI4P10075 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI4P10075 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI4P10075 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI4P10075 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI4P10075 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI4P10075 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI4P10075 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI4P10075 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI4P10075 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI4P10075 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI4P10075 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GLI4P10075 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLI4P10075 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLI4P10075 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLI4P10075 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLI4P10075 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLI4P10075 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GLI4P10075 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI4P10075 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI4P10075 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI4P10075 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI4P10075 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI4P10075 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI4P10075 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI4P10075 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI4P10075 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI4P10075 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI4P10075 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI4P10075 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI4P10075 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI4P10075 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI4P10075 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI4P10075 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI4P10075 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GLI4P10075 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI4P10075 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI4P10075 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI4P10075 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GLI4P10075 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLI4P10075 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLI4P10075 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLI4P10075 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLI4P10075 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLI4P10075 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLI4P10075 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GLI4P10075 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GLI4P10075 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GLI4P10075 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GLI4P10075 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GLI4P10075 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
GLI4P10075 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GLI4P10075 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GLI4P10075 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GLI4P10075 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms