Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CCDC159P0C7I6 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CCDC159P0C7I6 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CCDC159P0C7I6 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms