Protein–RNA interactions for Protein: P04156

PRNP, Major prion protein, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRNPP04156 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRNPP04156 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRNPP04156 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRNPP04156 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRNPP04156 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRNPP04156 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRNPP04156 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRNPP04156 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRNPP04156 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PRNPP04156 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRNPP04156 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PRNPP04156 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRNPP04156 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRNPP04156 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRNPP04156 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRNPP04156 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRNPP04156 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRNPP04156 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PRNPP04156 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
PRNPP04156 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRNPP04156 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRNPP04156 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRNPP04156 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRNPP04156 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRNPP04156 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PRNPP04156 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRNPP04156 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRNPP04156 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRNPP04156 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRNPP04156 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRNPP04156 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRNPP04156 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRNPP04156 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRNPP04156 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PRNPP04156 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRNPP04156 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRNPP04156 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRNPP04156 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRNPP04156 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRNPP04156 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PRNPP04156 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PRNPP04156 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PRNPP04156 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRNPP04156 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRNPP04156 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRNPP04156 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRNPP04156 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRNPP04156 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRNPP04156 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PRNPP04156 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRNPP04156 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRNPP04156 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRNPP04156 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRNPP04156 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PRNPP04156 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRNPP04156 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PRNPP04156 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRNPP04156 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRNPP04156 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRNPP04156 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRNPP04156 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRNPP04156 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRNPP04156 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRNPP04156 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
PRNPP04156 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRNPP04156 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRNPP04156 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRNPP04156 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRNPP04156 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRNPP04156 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRNPP04156 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRNPP04156 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
PRNPP04156 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
PRNPP04156 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRNPP04156 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRNPP04156 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRNPP04156 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRNPP04156 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
PRNPP04156 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
PRNPP04156 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRNPP04156 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRNPP04156 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRNPP04156 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRNPP04156 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRNPP04156 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
PRNPP04156 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRNPP04156 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRNPP04156 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRNPP04156 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRNPP04156 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
PRNPP04156 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRNPP04156 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRNPP04156 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PRNPP04156 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
PRNPP04156 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRNPP04156 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
PRNPP04156 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRNPP04156 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRNPP04156 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
PRNPP04156 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms