Protein–RNA interactions for Protein: P03372

ESR1, Estrogen receptor, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESR1P03372 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ESR1P03372 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ESR1P03372 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ESR1P03372 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ESR1P03372 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ESR1P03372 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ESR1P03372 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ESR1P03372 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ESR1P03372 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ESR1P03372 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ESR1P03372 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ESR1P03372 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ESR1P03372 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ESR1P03372 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ESR1P03372 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ESR1P03372 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ESR1P03372 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ESR1P03372 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ESR1P03372 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ESR1P03372 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ESR1P03372 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
ESR1P03372 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ESR1P03372 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ESR1P03372 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
ESR1P03372 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ESR1P03372 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ESR1P03372 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ESR1P03372 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ESR1P03372 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ESR1P03372 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ESR1P03372 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ESR1P03372 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ESR1P03372 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ESR1P03372 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ESR1P03372 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ESR1P03372 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ESR1P03372 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ESR1P03372 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ESR1P03372 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ESR1P03372 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ESR1P03372 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ESR1P03372 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ESR1P03372 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ESR1P03372 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ESR1P03372 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ESR1P03372 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ESR1P03372 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ESR1P03372 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ESR1P03372 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ESR1P03372 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ESR1P03372 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ESR1P03372 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ESR1P03372 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ESR1P03372 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ESR1P03372 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ESR1P03372 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ESR1P03372 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ESR1P03372 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ESR1P03372 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ESR1P03372 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ESR1P03372 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ESR1P03372 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ESR1P03372 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ESR1P03372 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ESR1P03372 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ESR1P03372 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ESR1P03372 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ESR1P03372 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ESR1P03372 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ESR1P03372 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ESR1P03372 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ESR1P03372 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ESR1P03372 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ESR1P03372 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ESR1P03372 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ESR1P03372 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ESR1P03372 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ESR1P03372 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ESR1P03372 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ESR1P03372 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ESR1P03372 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ESR1P03372 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ESR1P03372 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ESR1P03372 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ESR1P03372 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ESR1P03372 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ESR1P03372 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ESR1P03372 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ESR1P03372 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ESR1P03372 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ESR1P03372 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ESR1P03372 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ESR1P03372 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ESR1P03372 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
ESR1P03372 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
ESR1P03372 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ESR1P03372 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ESR1P03372 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ESR1P03372 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ESR1P03372 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms