Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1RP00736 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C1RP00736 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
C1RP00736 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1RP00736 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1RP00736 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1RP00736 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1RP00736 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1RP00736 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C1RP00736 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1RP00736 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1RP00736 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1RP00736 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1RP00736 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1RP00736 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1RP00736 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1RP00736 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C1RP00736 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1RP00736 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1RP00736 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1RP00736 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1RP00736 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1RP00736 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1RP00736 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1RP00736 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
C1RP00736 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1RP00736 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C1RP00736 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
C1RP00736 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1RP00736 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1RP00736 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1RP00736 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1RP00736 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C1RP00736 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C1RP00736 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
C1RP00736 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1RP00736 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1RP00736 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1RP00736 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1RP00736 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1RP00736 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
C1RP00736 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1RP00736 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1RP00736 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1RP00736 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C1RP00736 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1RP00736 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1RP00736 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1RP00736 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1RP00736 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1RP00736 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1RP00736 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1RP00736 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
C1RP00736 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1RP00736 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1RP00736 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1RP00736 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1RP00736 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1RP00736 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1RP00736 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1RP00736 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
C1RP00736 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1RP00736 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
C1RP00736 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
C1RP00736 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1RP00736 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1RP00736 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C1RP00736 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1RP00736 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1RP00736 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1RP00736 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1RP00736 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1RP00736 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1RP00736 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1RP00736 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1RP00736 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1RP00736 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C1RP00736 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C1RP00736 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C1RP00736 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C1RP00736 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
C1RP00736 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1RP00736 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1RP00736 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1RP00736 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1RP00736 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
C1RP00736 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
C1RP00736 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
C1RP00736 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
C1RP00736 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
C1RP00736 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
C1RP00736 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1RP00736 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1RP00736 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1RP00736 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
C1RP00736 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C1RP00736 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C1RP00736 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C1RP00736 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C1RP00736 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms