Protein–RNA interactions for Protein: O96006

ZBED1, Zinc finger BED domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZBED1O96006 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZBED1O96006 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
ZBED1O96006 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
ZBED1O96006 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms