Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
USP19O94966 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
USP19O94966 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
USP19O94966 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
USP19O94966 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
USP19O94966 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
USP19O94966 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
USP19O94966 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
USP19O94966 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
USP19O94966 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP19O94966 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP19O94966 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP19O94966 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP19O94966 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP19O94966 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP19O94966 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP19O94966 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP19O94966 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP19O94966 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP19O94966 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
USP19O94966 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC32.46■■■□□ 2.79
USP19O94966 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
USP19O94966 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
USP19O94966 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
USP19O94966 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
USP19O94966 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC32.45■■■□□ 2.78
USP19O94966 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
USP19O94966 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
USP19O94966 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC32.44■■■□□ 2.78
USP19O94966 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.43■■■□□ 2.78
USP19O94966 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
USP19O94966 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
USP19O94966 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
USP19O94966 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
USP19O94966 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
USP19O94966 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP19O94966 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
USP19O94966 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP19O94966 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP19O94966 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
USP19O94966 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP19O94966 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP19O94966 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP19O94966 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
USP19O94966 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP19O94966 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP19O94966 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP19O94966 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP19O94966 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP19O94966 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.41■■■□□ 2.78
USP19O94966 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP19O94966 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP19O94966 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP19O94966 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP19O94966 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP19O94966 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP19O94966 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
USP19O94966 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
USP19O94966 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
USP19O94966 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
USP19O94966 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
USP19O94966 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
USP19O94966 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
USP19O94966 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
USP19O94966 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
USP19O94966 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC32.39■■■□□ 2.78
USP19O94966 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
USP19O94966 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
USP19O94966 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
USP19O94966 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC32.38■■■□□ 2.77
USP19O94966 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
USP19O94966 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
USP19O94966 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
USP19O94966 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
USP19O94966 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
USP19O94966 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
USP19O94966 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
USP19O94966 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
USP19O94966 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
USP19O94966 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
USP19O94966 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
USP19O94966 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
USP19O94966 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
USP19O94966 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
USP19O94966 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
USP19O94966 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
USP19O94966 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
USP19O94966 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
USP19O94966 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
USP19O94966 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
USP19O94966 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
USP19O94966 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
USP19O94966 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
USP19O94966 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
USP19O94966 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
USP19O94966 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
USP19O94966 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
USP19O94966 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC32.32■■■□□ 2.76
USP19O94966 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
USP19O94966 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms