Protein–RNA interactions for Protein: O75208

COQ9, Ubiquinone biosynthesis protein COQ9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 318 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COQ9O75208 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
COQ9O75208 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COQ9O75208 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COQ9O75208 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COQ9O75208 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
COQ9O75208 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
COQ9O75208 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COQ9O75208 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COQ9O75208 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COQ9O75208 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COQ9O75208 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COQ9O75208 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
COQ9O75208 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COQ9O75208 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COQ9O75208 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
COQ9O75208 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COQ9O75208 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COQ9O75208 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
COQ9O75208 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
COQ9O75208 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
COQ9O75208 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COQ9O75208 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COQ9O75208 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
COQ9O75208 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COQ9O75208 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
COQ9O75208 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
COQ9O75208 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COQ9O75208 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COQ9O75208 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COQ9O75208 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
COQ9O75208 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
COQ9O75208 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COQ9O75208 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COQ9O75208 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COQ9O75208 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COQ9O75208 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
COQ9O75208 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
COQ9O75208 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COQ9O75208 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COQ9O75208 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COQ9O75208 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COQ9O75208 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
COQ9O75208 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COQ9O75208 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COQ9O75208 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COQ9O75208 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
COQ9O75208 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COQ9O75208 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
COQ9O75208 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COQ9O75208 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COQ9O75208 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
COQ9O75208 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
COQ9O75208 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
COQ9O75208 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COQ9O75208 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
COQ9O75208 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
COQ9O75208 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
COQ9O75208 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COQ9O75208 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
COQ9O75208 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COQ9O75208 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COQ9O75208 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COQ9O75208 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COQ9O75208 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COQ9O75208 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COQ9O75208 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
COQ9O75208 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
COQ9O75208 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COQ9O75208 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COQ9O75208 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COQ9O75208 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COQ9O75208 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COQ9O75208 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
COQ9O75208 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
COQ9O75208 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
COQ9O75208 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COQ9O75208 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COQ9O75208 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COQ9O75208 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COQ9O75208 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COQ9O75208 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COQ9O75208 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
COQ9O75208 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
COQ9O75208 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
COQ9O75208 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COQ9O75208 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
COQ9O75208 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COQ9O75208 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COQ9O75208 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COQ9O75208 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COQ9O75208 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COQ9O75208 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
COQ9O75208 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COQ9O75208 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
COQ9O75208 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COQ9O75208 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COQ9O75208 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
COQ9O75208 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
COQ9O75208 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
COQ9O75208 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms