Protein–RNA interactions for Protein: O60931

CTNS, Cystinosin, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNSO60931 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
CTNSO60931 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNSO60931 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNSO60931 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNSO60931 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNSO60931 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNSO60931 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNSO60931 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CTNSO60931 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNSO60931 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNSO60931 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNSO60931 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNSO60931 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNSO60931 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNSO60931 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNSO60931 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNSO60931 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNSO60931 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNSO60931 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CTNSO60931 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNSO60931 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNSO60931 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNSO60931 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CTNSO60931 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNSO60931 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNSO60931 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CTNSO60931 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNSO60931 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNSO60931 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNSO60931 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNSO60931 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNSO60931 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNSO60931 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNSO60931 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNSO60931 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CTNSO60931 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNSO60931 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNSO60931 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNSO60931 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNSO60931 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNSO60931 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNSO60931 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CTNSO60931 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
CTNSO60931 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNSO60931 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNSO60931 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNSO60931 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNSO60931 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNSO60931 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNSO60931 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
CTNSO60931 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNSO60931 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNSO60931 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNSO60931 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CTNSO60931 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNSO60931 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNSO60931 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNSO60931 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNSO60931 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNSO60931 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNSO60931 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNSO60931 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNSO60931 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNSO60931 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CTNSO60931 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNSO60931 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNSO60931 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNSO60931 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNSO60931 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNSO60931 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNSO60931 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNSO60931 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CTNSO60931 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNSO60931 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNSO60931 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNSO60931 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNSO60931 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNSO60931 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNSO60931 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNSO60931 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CTNSO60931 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNSO60931 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNSO60931 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNSO60931 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNSO60931 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNSO60931 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNSO60931 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNSO60931 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CTNSO60931 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNSO60931 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNSO60931 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNSO60931 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
CTNSO60931 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNSO60931 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNSO60931 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNSO60931 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNSO60931 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNSO60931 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNSO60931 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CTNSO60931 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms