Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.58■■■■■ 5.37
ABCC9O60706 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC48.58■■■■■ 5.37
ABCC9O60706 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC48.57■■■■■ 5.37
ABCC9O60706 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.57■■■■■ 5.37
ABCC9O60706 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC48.57■■■■■ 5.37
ABCC9O60706 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.57■■■■■ 5.37
ABCC9O60706 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC48.57■■■■■ 5.37
ABCC9O60706 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.57■■■■■ 5.37
ABCC9O60706 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC48.56■■■■■ 5.36
ABCC9O60706 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC48.56■■■■■ 5.36
ABCC9O60706 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC48.56■■■■■ 5.36
ABCC9O60706 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC48.56■■■■■ 5.36
ABCC9O60706 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
ABCC9O60706 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC48.55■■■■■ 5.36
ABCC9O60706 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC48.55■■■■■ 5.36
ABCC9O60706 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.54■■■■■ 5.36
ABCC9O60706 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC48.54■■■■■ 5.36
ABCC9O60706 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.54■■■■■ 5.36
ABCC9O60706 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC48.53■■■■■ 5.36
ABCC9O60706 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.53■■■■■ 5.36
ABCC9O60706 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.53■■■■■ 5.36
ABCC9O60706 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC48.52■■■■■ 5.36
ABCC9O60706 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC48.52■■■■■ 5.36
ABCC9O60706 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.51■■■■■ 5.36
ABCC9O60706 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC48.51■■■■■ 5.36
ABCC9O60706 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.5■■■■■ 5.35
ABCC9O60706 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.5■■■■■ 5.35
ABCC9O60706 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC48.49■■■■■ 5.35
ABCC9O60706 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC48.49■■■■■ 5.35
ABCC9O60706 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC48.48■■■■■ 5.35
ABCC9O60706 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC48.48■■■■■ 5.35
ABCC9O60706 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC48.48■■■■■ 5.35
ABCC9O60706 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC48.47■■■■■ 5.35
ABCC9O60706 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.46■■■■■ 5.35
ABCC9O60706 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC48.45■■■■■ 5.35
ABCC9O60706 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.45■■■■■ 5.35
ABCC9O60706 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC48.45■■■■■ 5.35
ABCC9O60706 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC48.45■■■■■ 5.35
ABCC9O60706 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC48.44■■■■■ 5.35
ABCC9O60706 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC48.44■■■■■ 5.35
ABCC9O60706 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC48.44■■■■■ 5.35
ABCC9O60706 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.44■■■■■ 5.34
ABCC9O60706 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.44■■■■■ 5.34
ABCC9O60706 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.44■■■■■ 5.34
ABCC9O60706 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC48.44■■■■■ 5.34
ABCC9O60706 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC48.43■■■■■ 5.34
ABCC9O60706 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.43■■■■■ 5.34
ABCC9O60706 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC48.43■■■■■ 5.34
ABCC9O60706 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC48.43■■■■■ 5.34
ABCC9O60706 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.42■■■■■ 5.34
ABCC9O60706 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC48.4■■■■■ 5.34
ABCC9O60706 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.4■■■■■ 5.34
ABCC9O60706 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC48.4■■■■■ 5.34
ABCC9O60706 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC48.4■■■■■ 5.34
ABCC9O60706 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.4■■■■■ 5.34
ABCC9O60706 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.39■■■■■ 5.34
ABCC9O60706 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.39■■■■■ 5.34
ABCC9O60706 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC48.38■■■■■ 5.34
ABCC9O60706 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC48.38■■■■■ 5.34
ABCC9O60706 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.37■■■■■ 5.33
ABCC9O60706 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC48.37■■■■■ 5.33
ABCC9O60706 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.37■■■■■ 5.33
ABCC9O60706 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC48.37■■■■■ 5.33
ABCC9O60706 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC48.37■■■■■ 5.33
ABCC9O60706 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC48.36■■■■■ 5.33
ABCC9O60706 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.36■■■■■ 5.33
ABCC9O60706 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC48.36■■■■■ 5.33
ABCC9O60706 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC48.36■■■■■ 5.33
ABCC9O60706 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC48.35■■■■■ 5.33
ABCC9O60706 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC48.32■■■■■ 5.33
ABCC9O60706 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC48.31■■■■■ 5.32
ABCC9O60706 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.31■■■■■ 5.32
ABCC9O60706 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC48.31■■■■■ 5.32
ABCC9O60706 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC48.31■■■■■ 5.32
ABCC9O60706 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC48.31■■■■■ 5.32
ABCC9O60706 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC48.3■■■■■ 5.32
ABCC9O60706 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC48.3■■■■■ 5.32
ABCC9O60706 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC48.29■■■■■ 5.32
ABCC9O60706 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC48.29■■■■■ 5.32
ABCC9O60706 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.29■■■■■ 5.32
ABCC9O60706 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC48.28■■■■■ 5.32
ABCC9O60706 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC48.28■■■■■ 5.32
ABCC9O60706 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC48.28■■■■■ 5.32
ABCC9O60706 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC48.28■■■■■ 5.32
ABCC9O60706 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.27■■■■■ 5.32
ABCC9O60706 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC48.27■■■■■ 5.32
ABCC9O60706 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.27■■■■■ 5.32
ABCC9O60706 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC48.27■■■■■ 5.32
ABCC9O60706 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC48.26■■■■■ 5.32
ABCC9O60706 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC48.26■■■■■ 5.32
ABCC9O60706 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC48.26■■■■■ 5.32
ABCC9O60706 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC48.25■■■■■ 5.31
ABCC9O60706 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC48.25■■■■■ 5.31
ABCC9O60706 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC48.24■■■■■ 5.31
ABCC9O60706 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC48.24■■■■■ 5.31
ABCC9O60706 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC48.24■■■■■ 5.31
ABCC9O60706 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC48.24■■■■■ 5.31
ABCC9O60706 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.24■■■■■ 5.31
ABCC9O60706 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC48.23■■■■■ 5.31
ABCC9O60706 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC48.23■■■■■ 5.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms