Protein–RNA interactions for Protein: O60391

GRIN3B, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 3B, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN3BO60391 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN3BO60391 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN3BO60391 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN3BO60391 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
GRIN3BO60391 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN3BO60391 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN3BO60391 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN3BO60391 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN3BO60391 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN3BO60391 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN3BO60391 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
GRIN3BO60391 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
GRIN3BO60391 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN3BO60391 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN3BO60391 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN3BO60391 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN3BO60391 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
GRIN3BO60391 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN3BO60391 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN3BO60391 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN3BO60391 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
GRIN3BO60391 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN3BO60391 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN3BO60391 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN3BO60391 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN3BO60391 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
GRIN3BO60391 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN3BO60391 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN3BO60391 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN3BO60391 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN3BO60391 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN3BO60391 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
GRIN3BO60391 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN3BO60391 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN3BO60391 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN3BO60391 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN3BO60391 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
GRIN3BO60391 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN3BO60391 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN3BO60391 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
GRIN3BO60391 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN3BO60391 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN3BO60391 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN3BO60391 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
GRIN3BO60391 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRIN3BO60391 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRIN3BO60391 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRIN3BO60391 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRIN3BO60391 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRIN3BO60391 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
GRIN3BO60391 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN3BO60391 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN3BO60391 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN3BO60391 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
GRIN3BO60391 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIN3BO60391 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIN3BO60391 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIN3BO60391 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIN3BO60391 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIN3BO60391 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC29.51■■■□□ 2.31
GRIN3BO60391 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN3BO60391 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
GRIN3BO60391 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
GRIN3BO60391 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN3BO60391 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN3BO60391 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN3BO60391 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN3BO60391 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
GRIN3BO60391 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN3BO60391 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN3BO60391 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN3BO60391 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN3BO60391 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN3BO60391 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
GRIN3BO60391 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIN3BO60391 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIN3BO60391 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
GRIN3BO60391 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
GRIN3BO60391 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GRIN3BO60391 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
GRIN3BO60391 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.31
GRIN3BO60391 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC29.45■■■□□ 2.31
GRIN3BO60391 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.45■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
GRIN3BO60391 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 146.7 ms