Protein–RNA interactions for Protein: O43812

DUX1, Double homeobox protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUX1O43812 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DUX1O43812 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUX1O43812 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUX1O43812 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
DUX1O43812 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUX1O43812 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUX1O43812 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUX1O43812 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUX1O43812 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DUX1O43812 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUX1O43812 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUX1O43812 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUX1O43812 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUX1O43812 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DUX1O43812 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUX1O43812 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUX1O43812 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
DUX1O43812 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUX1O43812 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUX1O43812 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUX1O43812 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DUX1O43812 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUX1O43812 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUX1O43812 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUX1O43812 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUX1O43812 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUX1O43812 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUX1O43812 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DUX1O43812 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUX1O43812 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUX1O43812 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUX1O43812 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUX1O43812 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUX1O43812 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUX1O43812 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
DUX1O43812 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUX1O43812 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUX1O43812 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DUX1O43812 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUX1O43812 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUX1O43812 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUX1O43812 VSTM2L-201ENST00000373459 831 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUX1O43812 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUX1O43812 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DUX1O43812 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUX1O43812 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUX1O43812 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUX1O43812 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUX1O43812 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUX1O43812 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUX1O43812 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUX1O43812 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
DUX1O43812 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUX1O43812 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUX1O43812 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DUX1O43812 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DUX1O43812 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DUX1O43812 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUX1O43812 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUX1O43812 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUX1O43812 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUX1O43812 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUX1O43812 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUX1O43812 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUX1O43812 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUX1O43812 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
DUX1O43812 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
DUX1O43812 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
DUX1O43812 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUX1O43812 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUX1O43812 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUX1O43812 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUX1O43812 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUX1O43812 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUX1O43812 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
DUX1O43812 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
DUX1O43812 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUX1O43812 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUX1O43812 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
DUX1O43812 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUX1O43812 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUX1O43812 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUX1O43812 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DUX1O43812 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUX1O43812 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUX1O43812 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUX1O43812 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
DUX1O43812 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
DUX1O43812 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUX1O43812 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUX1O43812 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUX1O43812 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUX1O43812 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUX1O43812 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DUX1O43812 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DUX1O43812 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
DUX1O43812 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUX1O43812 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUX1O43812 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
DUX1O43812 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.7 ms