Protein–RNA interactions for Protein: O43464

HTRA2, Serine protease HTRA2, mitochondrial, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTRA2O43464 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
HTRA2O43464 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
HTRA2O43464 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HTRA2O43464 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTRA2O43464 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms