Protein–RNA interactions for Protein: O43402

EMC8, ER membrane protein complex subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC8O43402 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
EMC8O43402 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMC8O43402 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMC8O43402 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMC8O43402 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMC8O43402 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMC8O43402 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMC8O43402 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMC8O43402 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMC8O43402 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMC8O43402 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMC8O43402 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
EMC8O43402 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
EMC8O43402 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMC8O43402 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMC8O43402 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMC8O43402 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMC8O43402 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
EMC8O43402 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMC8O43402 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMC8O43402 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMC8O43402 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMC8O43402 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
EMC8O43402 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMC8O43402 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMC8O43402 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMC8O43402 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMC8O43402 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMC8O43402 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMC8O43402 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMC8O43402 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMC8O43402 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMC8O43402 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMC8O43402 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
EMC8O43402 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMC8O43402 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMC8O43402 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMC8O43402 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
EMC8O43402 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMC8O43402 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMC8O43402 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMC8O43402 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMC8O43402 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMC8O43402 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
EMC8O43402 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMC8O43402 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMC8O43402 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
EMC8O43402 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMC8O43402 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMC8O43402 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMC8O43402 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
EMC8O43402 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
EMC8O43402 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EMC8O43402 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EMC8O43402 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
EMC8O43402 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EMC8O43402 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
EMC8O43402 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
EMC8O43402 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMC8O43402 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMC8O43402 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMC8O43402 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMC8O43402 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
EMC8O43402 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMC8O43402 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMC8O43402 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMC8O43402 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMC8O43402 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMC8O43402 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
EMC8O43402 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMC8O43402 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMC8O43402 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMC8O43402 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMC8O43402 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMC8O43402 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
EMC8O43402 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMC8O43402 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMC8O43402 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMC8O43402 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
EMC8O43402 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMC8O43402 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMC8O43402 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMC8O43402 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMC8O43402 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
EMC8O43402 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMC8O43402 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMC8O43402 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMC8O43402 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMC8O43402 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMC8O43402 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMC8O43402 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMC8O43402 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMC8O43402 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
EMC8O43402 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMC8O43402 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMC8O43402 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMC8O43402 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EMC8O43402 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
EMC8O43402 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
EMC8O43402 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms