Protein–RNA interactions for Protein: O14920

IKBKB, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKBO14920 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
IKBKBO14920 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IKBKBO14920 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
IKBKBO14920 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
IKBKBO14920 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
IKBKBO14920 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.49■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
IKBKBO14920 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
IKBKBO14920 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IKBKBO14920 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IKBKBO14920 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
IKBKBO14920 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IKBKBO14920 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
IKBKBO14920 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IKBKBO14920 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IKBKBO14920 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IKBKBO14920 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IKBKBO14920 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IKBKBO14920 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
IKBKBO14920 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
IKBKBO14920 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms