Protein–RNA interactions for Protein: O14879

IFIT3, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFIT3O14879 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
IFIT3O14879 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
IFIT3O14879 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFIT3O14879 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFIT3O14879 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFIT3O14879 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
IFIT3O14879 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
IFIT3O14879 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFIT3O14879 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFIT3O14879 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFIT3O14879 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFIT3O14879 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
IFIT3O14879 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
IFIT3O14879 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFIT3O14879 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFIT3O14879 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFIT3O14879 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFIT3O14879 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
IFIT3O14879 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFIT3O14879 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFIT3O14879 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFIT3O14879 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFIT3O14879 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFIT3O14879 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFIT3O14879 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
IFIT3O14879 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IFIT3O14879 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IFIT3O14879 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IFIT3O14879 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
IFIT3O14879 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
IFIT3O14879 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
IFIT3O14879 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IFIT3O14879 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
IFIT3O14879 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IFIT3O14879 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
IFIT3O14879 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
IFIT3O14879 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IFIT3O14879 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IFIT3O14879 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IFIT3O14879 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
IFIT3O14879 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IFIT3O14879 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
IFIT3O14879 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
IFIT3O14879 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
IFIT3O14879 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFIT3O14879 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
IFIT3O14879 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms