Protein–RNA interactions for Protein: O00287

RFXAP, Regulatory factor X-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFXAPO00287 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RFXAPO00287 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFXAPO00287 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFXAPO00287 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFXAPO00287 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFXAPO00287 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFXAPO00287 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFXAPO00287 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RFXAPO00287 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFXAPO00287 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFXAPO00287 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFXAPO00287 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFXAPO00287 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RFXAPO00287 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFXAPO00287 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFXAPO00287 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFXAPO00287 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFXAPO00287 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFXAPO00287 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RFXAPO00287 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFXAPO00287 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFXAPO00287 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFXAPO00287 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFXAPO00287 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFXAPO00287 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFXAPO00287 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFXAPO00287 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RFXAPO00287 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFXAPO00287 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFXAPO00287 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFXAPO00287 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
RFXAPO00287 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RFXAPO00287 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RFXAPO00287 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RFXAPO00287 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFXAPO00287 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RFXAPO00287 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFXAPO00287 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFXAPO00287 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFXAPO00287 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RFXAPO00287 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73.4 ms