Protein–RNA interactions for Protein: H3BUS1

SYS1-DBNDD2, SYS1-DBNDD2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MED17-221ENST00000639724 2317 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
SYS1-DBNDD2H3BUS1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SYS1-DBNDD2H3BUS1 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.8 ms